Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssh3Q8K330 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssh3Q8K330 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms