Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gtf3c1Q8K284 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gtf3c1Q8K284 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms