Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ep400Q8CHI8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms