Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Fam228aQ8CDW1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam228aQ8CDW1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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