Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc38Q8CDN8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc38Q8CDN8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc38Q8CDN8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc38Q8CDN8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccdc38Q8CDN8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc38Q8CDN8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc38Q8CDN8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ccdc38Q8CDN8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc38Q8CDN8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms