Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb1Q8CBF3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb1Q8CBF3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms