Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slfn5Q8CBA2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slfn5Q8CBA2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms