Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfibp1Q8C8U0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms