Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot2Q8C5L3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnot2Q8C5L3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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