Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfrp1Q8C4U3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms