Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nhlrc2Q8BZW8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms