Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tnfsfm13Q8BXS2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms