Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trerf1Q8BXJ2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trerf1Q8BXJ2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms