Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rbbp5Q8BX09 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms