Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp38Q8BW70 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp38Q8BW70 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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