Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp4f39Q8BGU0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp4f39Q8BGU0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms