Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfascQ810U3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms