Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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IfneQ80ZF2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IfneQ80ZF2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms