Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alkbh8Q80Y20 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms