Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg2bQ80XK6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms