Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2eQ80UW8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms