Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ube3cQ80U95 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ube3cQ80U95 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms