Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ube2q1Q7TSS2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2q1Q7TSS2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms