Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccp110Q7TSH4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms