Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Actn1Q7TPR4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Actn1Q7TPR4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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