Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Sys1Q78S06 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Sys1Q78S06 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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