Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc44a1Q6X893 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms