Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms