Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt3Q6PE13 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms