Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Taf1cQ6PDZ2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms