Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc85bQ6PDY0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms