Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AtminQ6P9S1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AtminQ6P9S1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms