Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atg2aQ6P4T0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms