Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SphkapQ6NSW3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms