Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cep78Q6IRU7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cep78Q6IRU7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms