Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Carmil1Q6EDY6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Carmil1Q6EDY6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms