Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Atg9bQ6EBV9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atg9bQ6EBV9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atg9bQ6EBV9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atg9bQ6EBV9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atg9bQ6EBV9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Atg9bQ6EBV9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Atg9bQ6EBV9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg9bQ6EBV9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms