Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smarca2Q6DIC0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smarca2Q6DIC0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms