Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg9aQ68FE2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms