Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irf4Q64287 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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