Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Defa17Q64016 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Defa17Q64016 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Defa17Q64016 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Defa17Q64016 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Defa17Q64016 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Defa17Q64016 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Defa17Q64016 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Defa17Q64016 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Defa17Q64016 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Defa17Q64016 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Defa17Q64016 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Defa17Q64016 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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