Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl12Q62401 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl12Q62401 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl12Q62401 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl12Q62401 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl12Q62401 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl12Q62401 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl12Q62401 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccl12Q62401 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccl12Q62401 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms