Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ss18Q62280 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ss18Q62280 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ss18Q62280 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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