Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpaQ62189 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SnrpaQ62189 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms