Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gbp4Q61107 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gbp4Q61107 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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