Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxd4Q60688 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms