Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms