Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms