Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Nlrc3Q5DU56 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nlrc3Q5DU56 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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