Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2f8Q58FA4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms